Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ELL3Q9HB65 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ELL3Q9HB65 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ELL3Q9HB65 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ELL3Q9HB65 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ELL3Q9HB65 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELL3Q9HB65 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms