Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD3Q9H7B4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMYD3Q9H7B4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms