Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700029F12RikQ9CRB4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms