Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHLHE41Q9C0J9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms