Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A8Q9BY19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A8Q9BY19 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms