Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSM14BQ9BX40 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms