Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP2Q9BSJ2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms