Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mccc1Q99MR8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mccc1Q99MR8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.8 ms