Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGMNQ99538 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms