Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms