Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTAGE1Q96RT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms