Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMTK3Q96Q04 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMTK3Q96Q04 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms