Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC7Q96M83 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC7Q96M83 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms