Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEIL1Q96FI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEIL1Q96FI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms