Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDC3Q96F86 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDC3Q96F86 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms