Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1AQ96AJ9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms