Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSR2Q969E8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TSR2Q969E8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms