Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC107Q8WV48 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms