Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms