Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC33Q8N5R6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC33Q8N5R6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms