Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms