Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms