Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc50Q810U5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms