Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRCAPQ6ZRS2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRCAPQ6ZRS2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRCAPQ6ZRS2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms