Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf653Q6YND2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf653Q6YND2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms