Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BLOC1S2Q6QNY1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BLOC1S2Q6QNY1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms