Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNNM4Q6P4Q7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNNM4Q6P4Q7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms