Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A4Q6AI14 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A4Q6AI14 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms