Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sema5bQ60519 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Sema5bQ60519 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sema5bQ60519 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms