Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2LQ5T4T6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms