Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN11Q5T124 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN11Q5T124 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms