Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAX1Q5SQQ9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms