Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms