Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP221Q4G0U5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP221Q4G0U5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms