Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TQQ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TQQ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q3TQQ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TQQ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3TQQ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3TQQ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q3TQQ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms