Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PROX2Q3B8N5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PROX2Q3B8N5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms