Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBX1Q14549 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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GBX1Q14549 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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GBX1Q14549 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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GBX1Q14549 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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GBX1Q14549 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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GBX1Q14549 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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GBX1Q14549 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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GBX1Q14549 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GBX1Q14549 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GBX1Q14549 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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