Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3BQ13214 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA3BQ13214 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms