Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	HAT2	YEL056W	1206 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	POP6	YGR030C	477 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	FOL2	YGR267C	732 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CDC12	YHR107C	1224 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YKL091C	YKL091C	933 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	NIT3	YLR351C	876 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	UNG1	YML021C	1080 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	SPO20	YMR017W	1194 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RIB4	YOL143C	510 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	PLP2	YOR281C	861 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RPS23B	YPR132W	438 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MGA1	YGR249W	1371 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	GYP6	YJL044C	1377 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	TEC1	YBR083W	1461 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	STT4	YLR305C	5703 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YKR015C	YKR015C	1707 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YVC1	YOR087W	2028 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	FRQ1	YDR373W	573 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CNN1	YFR046C	1086 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RPN13	YLR421C	471 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YLR444C	YLR444C	303 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YNL234W	YNL234W	1281 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	SIL1	YOL031C	1266 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	AGA1	YNR044W	2178 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CHS2	YBR038W	2892 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	STP2	YHR006W	1626 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MEF1	YLR069C	2286 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	STP1	YDR463W	1560 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CTH1	YDR151C	978 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	DDI2	YFL061W	678 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	DID4	YKL002W	699 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MTR2	YKL186C	555 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	DDI3	YNL335W	678 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	PEX11	YOL147C	711 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	TAF3	YPL011C	1062 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CDH1	YGL003C	1701 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	TFB2	YPL122C	1542 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	TRE2	YOR256C	2430 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CHK1	YBR274W	1584 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YDL071C	YDL071C	375 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	TOS8	YGL096W	831 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RPS0A	YGR214W	759 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	OMA1	YKR087C	1038 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	OCA2	YNL056W	594 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YNL320W	YNL320W	855 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CYC2	YOR037W	1101 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	BUD21	YOR078W	645 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RFM1	YOR279C	933 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CLN2	YPL256C	1638 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	SNQ2	YDR011W	4506 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	COP1	YDL145C	3606 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RRM3	YHR031C	2172 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	ISM1	YPL040C	3009 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	GIS4	YML006C	2325 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	DSN1	YIR010W	1731 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	TFC1	YBR123C	1950 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	VPS53	YJL029C	2469 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CLG1	YGL215W	1359 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YCR015C	YCR015C	954 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YOS1	YER074W-A	258 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YGL214W	YGL214W	486 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YKE4	YIL023C	1041 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	EBP2	YKL172W	1284 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	SEC14	YMR079W	915 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MDJ2	YNL328C	441 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YBL096C	YBL096C	309 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	DAP2	YHR028C	2457 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YHR202W	YHR202W	1809 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YDR391C	YDR391C	699 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	WBP1	YEL002C	1293 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YIL175W	YIL175W	318 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	BUR2	YLR226W	1188 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	MRPS17	YMR188C	714 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	DSC2	YOL073C	969 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	HSH49	YOR319W	642 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YBR053C	YBR053C	1077 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	MUM2	YBR057C	1101 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	OXR1	YPL196W	822 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	TRM1	YDR120C	1713 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	REC8	YPR007C	2043 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	MTH1	YDR277C	1302 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YFL040W	YFL040W	1623 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	KAP104	YBR017C	2757 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	ARG2	YJL071W	1725 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	ERG2	YMR202W	669 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	IRC14	YOR135C	342 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	SMC2	YFR031C	3513 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	OAF3	YKR064W	2592 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	PST1	YDR055W	1335 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VIK1	Q12045	YGR117C	YGR117C	1431 nt		3.13	□□□□□ -1.91

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