Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC15Q0P6D6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC15Q0P6D6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms