Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 SHU2YDR078C 672 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 NSE3YDR288W 912 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 DUO1YGL061C 744 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 SPC24YMR117C 642 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 UAF30YOR295W 687 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 YBR096WYBR096W 693 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 CPA2YJR109C 3357 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 BUD4YJR092W 4344 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 ATG26YLR189C 3597 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 CAF130YGR134W 3369 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 SIZ1YDR409W 2715 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 GRX3YDR098C 858 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 RPS8BYER102W 603 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 PHD1YKL043W 1101 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 RAD10YML095C 633 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 TAF4YMR005W 1167 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 ERG2YMR202W 669 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 RPS8AYBL072C 603 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 USV1YPL230W 1176 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 FLO1YAR050W 4614 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 TSC11YER093C 4293 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 CUE3YGL110C 1875 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 SRC1YML034W 2505 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 CLG1YGL215W 1359 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 PET54YGR222W 882 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 RAD2YGR258C 3096 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 NDT80YHR124W 1884 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 ENT3YJR125C 1227 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 RPL17AYKL180W 555 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 RRG9YNL213C 645 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 YBL094CYBL094C 333 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 RPS11BYBR048W 471 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 HPA2YPR193C 471 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 PHO5YBR093C 1404 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 ISM1YPL040C 3009 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 TGL3YMR313C 1929 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG39Q06159 PSF1YDR013W 627 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 CIR1YGR207C 786 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YPT35YHR105W 645 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 RFM1YOR279C 933 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 MRPL37YBR268W 318 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 OAF3YKR064W 2592 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YKR015CYKR015C 1707 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YPR148CYPR148C 1308 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 HAP4YKL109W 1665 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 PDS1YDR113C 1122 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 VMA8YEL051W 771 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 PCD1YLR151C 1023 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 SSU72YNL222W 621 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 TIR2YOR010C 756 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 HSH49YOR319W 642 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YPL071CYPL071C 471 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 DIB1YPR082C 432 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 snR63snR63 255 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 MED2YDL005C 1296 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 RPA14YDR156W 414 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 SCL1YGL011C 759 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 SCM4YGR049W 564 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 CAB2YIL083C 1098 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YJR111CYJR111C 852 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 MSA2YKR077W 1092 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YOR082CYOR082C 342 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YBR053CYBR053C 1077 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 PST1YDR055W 1335 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 BSC1YDL037C 987 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YDL162CYDL162C 357 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YDR391CYDR391C 699 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 RMT2YDR465C 1239 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 BCD1YHR040W 1101 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 ERP1YAR002C-A 660 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 HRT3YLR097C 1035 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 BUR2YLR226W 1188 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 RPN13YLR421C 471 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 DGA1YOR245C 1257 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 PLP2YOR281C 861 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YIG1YPL201C 1386 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 CHK1YBR274W 1584 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 RPA135YPR010C 3612 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 TRE2YOR256C 2430 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 SDS23YGL056C 1584 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 BMH2YDR099W 822 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 FRQ1YDR373W 573 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 EDC1YGL222C 528 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 RPS23AYGR118W 438 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 MRPS35YGR165W 1038 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YAL069WYAL069W 315 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 YLR444CYLR444C 303 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG39Q06159 TIF34YMR146C 1044 nt2.67□□□□□ -1.98
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