Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBXN1Q04323 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN1Q04323 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms