Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAX2Q02962 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAX2Q02962 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms