Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFAMQ00059 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAMQ00059 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms