Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HPCAP84074 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HPCAP84074 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HPCAP84074 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPCAP84074 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPCAP84074 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HPCAP84074 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HPCAP84074 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPCAP84074 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPCAP84074 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPCAP84074 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPCAP84074 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPCAP84074 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms