Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx1P80205 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms