Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IL13RA1P78552 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IL13RA1P78552 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms