Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG2P63267 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms