Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKP1P63208 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SKP1P63208 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP1P63208 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP1P63208 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP1P63208 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP1P63208 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP1P63208 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SKP1P63208 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SKP1P63208 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms