Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UbdP63072 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UbdP63072 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UbdP63072 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UbdP63072 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UbdP63072 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UbdP63072 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UbdP63072 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms